京城相对应的中央机构，不过在这两京制度当中，由于皇帝和内阁大学士等决策人都在京城，因此京城的六衙门才是实际的掌权机构，而南京的各衙门多为虚衔，在此地任职的官员又被称为“吏隐”。

至于南京六都察院大臣当中，则有南京礼侍郎钱谦益、南京尚书弘图、右都御史张慎言、南京兵侍郎吕大等人。

“臣等拜见陛下，陛下万岁万岁万万岁！”

崇祯发一声长长的叹息，大明朝从未有过的屈辱，让他产生了一痛彻肺腑的觉。

“朕实在是愧对大明的列祖列宗，若是不能还于旧都，不知以何面目相对？”

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众人汇聚在殿中，对着崇祯皇帝行大礼参拜，不过人人神之中都微微有些忧虑，他们当中大分人都是原来的留都人选，自然对于未来有些忐忑不安，唯独只有南京兵尚书史可法却是面如常，黝黑的脸庞上并未有半惊惶。

如果在原来的历史上，崇祯选择自尽之后，南京留守六衙门并不存在这个问题，因为北方逃亡而来的官员人数过少，且不成气候，很难威胁到南京留守六衙门，可是如今崇祯既然还活着，再加上一分的文武大臣齐齐南下，便使得南京的局势变得复杂起来。

在众臣行礼过后，南京兵尚书史可法率先拱手：“启禀陛下，北都失陷贼手，南北之耗莫通，河山之险尽失，臣等诚为惶恐之至，幸得陛下圣安稳，当号召天下臣民起义勤王捐赀，剿灭贼寇，收复京师。”

而在留都当中真正握有实权的人只有三个人，分别是南京参赞机务兵尚书史可法、南京守备太监韩赞周以及提督南京军务勋臣赵之龙，当然在这些人之外，还有魏国公徐允爵，保国公张国弼，隆平侯张拱日，临淮侯李祖述，驸齐赞元等勋贵。

崇祯望着下面的大臣们，心中却未免有些叹息，太朱慈烺在京城中大动戈，固然捞得了很多银，可是也使得从北面下来的勋贵大臣们数量并不多，而这些人在南下之后，很显然会在事权方面同南京的留守朝廷产生了一定的。

此外，东虏关的消息也让崇祯有些微微焦虑，他知东虏肯定不会放过下这个趁火打劫的机会，如果东虏选择和寇联手，那么对于此时的大明朝而言，将很难承受这样惨烈的打击。

众臣听到崇祯这番慨肺腑之言后，却齐声痛哭起来，很显然京都的失陷让大臣们产生了一哀泣之情，他们的嚎哭声引得崇祯的圈也为之一红，颗颗泪不由得掉落了下来。

京城的失陷使得此时的明王朝陷了风雨飘摇的境地，而此时君臣们也都开始思考一个问题，那就是针对两淮之间的防御成为了下朝廷最为要的事情，绝不能让闯逆顺着两淮一路南下。

当然这终究是一个好事，因为崇祯的存活使得大明朝并没有陷群龙无首的状态，大家伙不背地里怎么，明面上依然是团结在崇祯皇帝为首的旗帜下。

崇祯皇帝微微，：“朕南下避难江淮，夙夜竞竞，痛社稷之墟，惟思迅扫妖氛，廓清大难，犹赖尔臣民，其与天下更始。”