同年，于控制地方的考虑，秀保与姬之三孝仁亲王、与亭持之晴仁亲王臣籍降下。

久我氏代表的村上源氏，在战国时期曾一度把握源氏长者的称号，对秀保夺取之事多有不满，因秀保代表的河内（清和）源氏自视正统，便索将其贬为民籍；

此外，纪伊丰臣氏、尾张丰臣氏（丰臣秀房接受丰臣本姓，但婉拒更改苗字，仍使用其祖父三好苗字）也被纳摄关家。排名来看，依次是纪伊丰臣氏、大和丰臣氏、尾张丰臣氏、今川（亭）氏、鹰司氏。

因此，将利、京极三家纳清华家并下赐丰臣氏，算是对其地位的重新确认。而给予前田、蒲生、结城三家与力大名清华家格，多是考虑其对幕府颁布的教令比较顺从，特别是对“永宁双令”的执行较为彻底。

、今川七家，其中三条、西园寺、德大寺是藤原北家闲院，山院、大炊御门是藤原北家师实（御堂分支），久我是村上源氏，祖上源师房是藤原师通养，与藤原北家御堂关系密；今川是西园寺分支，因此排在末位。

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首先便是例数历代藤原氏对皇权的蔑视和架空，指责其违背祖神之承诺；接着便以参与此次谋反为由，将朱台盘（藤氏长者的信）、藤氏长者印、渡庄券文（摄关家所领之地券）等和摄关家的正邸东三条殿从近卫家接过来。

所谓二神约诺神话，实际上是十一世纪中期，因由摄关家辅弼皇室之现实而诞生的，藤原氏借助神话的再构建，对自的通知合法行调。秀保此番改革，重就是削弱上述两大家格公家的正统，而将这个寄生在皇室之上的权门彻底剥离去。

增补的清华家包括如下五家：

蒲生氏，秀保亲家，原为藤原朝臣，丰臣朝臣赐下；

前田氏，地方藩，菅原朝臣；

其实，皇籍奉还后，秀保便开始将秀吉时期滥赐的丰臣姓和羽柴氏全收回，仅赐予少数确有血缘或姻亲关系的大名。

前者改回原名丰臣秀孝，封地降至北大和（新庄）十五万石，晋位中纳言，承袭大和丰臣氏；

随后，令近卫经季复归今川氏，仍为太政大臣，提今川氏为摄关家格，并由今川经季接任藤氏长者，位在鹰司氏之前。

后者改回原名丰臣秀晴，封地降至和泉（岸和田）十二万石，晋位权大纳言，并赐予摄关家格，成为秀保一族在公家的代言人。

利氏，秀保之孙，原为大江朝臣，丰臣朝臣赐下；

不仅如此，还直接将近卫、九条、二条、一条贬为民籍，但对未参与谋反的鹰司氏网开一面，仍准予保留摄关家格，并且贬为民籍的公家成员中来自鹰司氏的也可以复归，但位次上只能排在末位；

京极氏，秀赖亲家，中京极常之娘家，原为宇多源氏，丰臣朝臣赐下。

结城氏，秀保亲家，原为藤原朝臣，丰臣朝臣赐下；

经此“公家整治”，伏见确立了对公家的主导权，公武合也一步加，可以说，秀保已然站上了权力的峰，就连当年“此世即吾世，如月满无缺”的藤原长也难望其项背，且这一切都是源于自己无可比拟的势力，而非凭借所谓外戚，更是让人无法置喙。

至于清华家，自御堂的山院、大炊御门都受到牵连，划重新设置的名臣家（旧大臣家、羽林家、名家、半家打后重现设置大臣家和名臣家）；

三条、西园寺、德大寺三家，经今川一族求情，除了三条以外，西园寺也得以保留家格但位居末位，德大寺则贬为大臣家。