东汉中央政府的官员分省官、官、外官三大系统。内官、外朝的区分古已有之，而在廷之中，皇帝日常起居的区域称省中（亦称“禁中”），因此内官员中又有官与声官的区分。

在皇帝边执役、照顾皇帝日常生活的是宦官，省中的宦者均隶属黄门令辖。省内的禁卫工作亦由宦官但任。

尚书台是皇帝的秘书机关，其官署设在廷之内、禁省之外。它的主要执掌是理章奏文书、起草诏令，但实际上政务都由上书抬代表君主执掌，权力极大。上书台设长官（令）一人、副长官（仆）一人，下设尚书六人分十八人。沟通上书台与皇帝联系的官员有侍中、中常侍、黄门侍郎等。其中，侍中由士人充任；中常侍、黄门侍郎则由宦者承担。侍中有事才禁省，中常侍、黄门侍郎则日常居住在省中，因此，虽然三者之中侍中的级别最、中常侍次之，但与君主的亲密程度，则以中常侍为最。内省外的禁卫工作由九卿中的光碌勋与卫尉负责，光碌勋偏于内，卫尉偏于外。光碌勋下属五官、左、右、虎贲、羽林等五名郎将，中郎将以下有中郎、侍郎、郎中等官。光碌勋的禁卫力量是郎官，卫尉的禁卫力量是武装卫士，所以，卫尉在卫事务中的地位相当重要。

外官主要有三公九卿，他们是中央政府的主要行政官员。

三公指太尉、司徒、司空，他们的品级最，名义上的职责是辅导皇帝主持国家政务；三公之上还有太傅，其职责辅导皇帝，但不常设。东汉的实际政务都同属尚书台，因此，三公、太傅如没有“录尚书事”的衔，就是没有实权的虚职。三公的属官有长史一名，掾属、令史、御属各二、三十名。其中，长史是三公的主要副手，掾、属是分事务的门负责人（掾是正职，属是副职），除长史由朝廷任命外，其他属官均由三公自行聘用。

九卿是太常、光掾、卫尉、太仆、廷尉、大鸿胪、宗正、大司农、少府。他们各自分的政务是：太长掌典礼，光碌勋、卫尉掌省禁卫，太仆掌皇帝车，廷尉掌司法，大鸿胪掌接待诸侯与少数名族，宗正掌皇族事务，大司农掌国家财政收支，少府掌皇帝用服饰。九卿各官的长官是卿，副职为丞；其下分设各官理事务，大以令为正职，丞为副职。

与九卿级别相当的外官（亦称“列卿”）还有执金吾、将作大匠、大长秋等。其中，执金吾负责廷之外、都城之内的治安（都城门另有城门校尉负责守卫），将作大匠负责宗庙殿堂、室陵园等土木工程，其副手为丞，下属的门负责亦以令为正职，丞为副职；大长秋主皇后事。质与就卿中的少府类似，由宦者担当。皇位继承人太正式确立之后，有专门隶属太的东。其设官大与政府类似，但分级没有后者细密。东官职均冠“太”，如太太傅、太少傅、太家令等。

在军事方面，相当三公的中央级官员有大将军、骠骑将军、车骑将军、卫将军，相当九卿的有前、后、左、右将军，均不常设。其属官与三公相同，唯在长史之下另有司一人，主军务；从事中郎二人，职掌参谋，均由朝廷任命。将军直接领兵的，在、曲、屯等建置上分别设校尉、司、军侯、屯长等统兵官。

常备军由中央与地方军（郡国兵）组成。中央军中，京师卫戍队由城门校尉统领，野战队（北军）由北军中侯统领。北军下辖五个兵的，番号分别为屯骑（骑兵）、越骑（特兵）、步兵、长（军）、声（弓箭）。长官为校尉，副职司。全军总数约五千人不到。北军平十卒驻屯在京城长君主宿卫、助理首都治安，发生战事就成为组建征步枪队的心。地方上的郡国兵经东汉初期多次裁撤、削减，只剩下边郡与内地关隘的少数驻军。遇有战，都是临时募兵或调京师北军战。

地方系统