1946年5月，国民政府从重庆还都南京，国共谈判也转到南京举行。蒋介石借共产党拒绝从苏北、皖北等地撤退，公然调集二十万军队，于6月大举围攻以宣化店为中心的中原解放区，发动全面内战。/p

1937年－1945年间，国民革命军所属第五军、第十军、第十三军、第十八军、第二十六军、第五十二军、第五十九军、第七十四军，新一军及新六军总计与日军共在38,931次小型战斗、1,117次重大战役、22场大会战中较量，伤亡人数达330余万人（1937年至1945年间的补充兵员）。国民革命军虽因装备等因素无法取得绝对优势，但也于台儿庄、淞沪、长沙、独山等正规战，上海、笕桥等空战中给予日军重创。

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1945年8月初，国在日本广岛与长崎先后投下武，日本天皇于8月15日宣布无条件投降。日本帝国于9月2日与盟国签订降伏文书，接受《开罗宣言》及《波茨坦宣言》规定、归还占领之外国领土。遂即满洲国瓦解，汪卫政府覆亡，台澎诸岛后由中华民国行接收。

1946年1月政治协商会议在重庆召开，政治协商会议通过了有利于人民的决议，受到全国人民的迎。国民党虽然也宣布批准政协决议，但提许多保留条件。接着，在3月间召开的国民党六届二中全会上则公然不承认政协会议的约束力，继续鼓一党专政。同时对全国人民要求遵守政协决议和反对内战的活动横加破坏镇压，制造了“较场事件”、“李闻血案”及“下关惨案”等血事件。

1941年12月7日，日本偷袭珍珠港，中英正式对日德意宣战，中国战区遂正式成为二战盟军反法西斯战争战场。盟军委托蒋中正任中国战区（越南、泰国、棉，棉为今柬埔寨、老挝）统帅，派史迪威中将任蒋参谋长。英国封锁之滇缅路亦开放向中国后方运补。同时，国军也派锐队远征南方，留下了转战缅因、血战昆仑关等事迹。

到1946年方订定中华民国宪法并于1947年颁行，训政时期始告结束。1936年5月拟定“五五宪草”预备正式立宪。后因中日战争爆发，立宪遂向后拖延。当时国民政府主席为林森（1932年－1943年），行政院长为汪卫（1932年－1935年），军事委员会委员长为蒋介石（1932年－）。汪卫因屡遭国民党内压力，后亡河内，与日本接，应允反共，停止抗日，于1940年在南京另组一个汪伪国民政府。该政府仅获教廷、意大利、纳粹德国、伪满洲国的承认。汪卫于1944年病死东京。

1937年，日本先后攻陷华北、淞沪、南京，占据中国大量领土，国民政府被迫自南京迁往重庆，展开十四年抗战的后八年全面抗战。当时，中华民国所属国民革命军投战争计步兵128个师、46个独立旅﹔骑兵9个师，又6个独立旅﹔炮兵4旅，20个独立团，正规军合计170万人。