1089年任杭州太守兼浙西军区司令

1091年任吏尚书；往京都；任颍州太守

1092年任扬州太守；兵尚书；礼尚书

1093年妻丧；太后逝世；调定州太守；河北军区司令

1094年往惠州贬所；谪居惠州

1097年往海南；谪居海南儋州

徽宗（1101～1126）太后执政（1100）

1101年，北返；往常州；建中靖国元年七月二十八日逝世，享年66岁

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乌台诗案

宋神宗在熙宁年间（1068～1077）重用王安石变法，变法失利后，又在元丰年间（1078～1085）从事改制。就在变法到改制的转折关，发生了苏轼乌台诗案。这案件先由监察御史李定告发，后在御史台狱受审。御史台自汉代以来即别称“乌台”，所以此案称为“乌台诗案”。

北宋神宗年间苏轼因为反对新法，并在自己的诗文表了对新政的不满。由于他当时是文坛的领袖，任由苏轼的诗词在社会上传播对新政的推行很不利。所以在神宗的默许下，苏轼被抓乌台，一关就是4个月，每天被要代他以前写的诗的由来和词句中典故的。

由于宋朝有不杀士大夫的惯例，所以苏轼免于一死，但被贬为黄州团练副使。元丰二年（1079年），苏轼移任湖州（浙江省吴兴县），七月遭御史台所派遣的皇甫遵等人逮捕狱，他们指证苏轼在诗文中歪曲事实,诽谤朝廷。御史李定、何正臣、舒亶等人，举苏轼的《杭州纪事诗》为证据，说他“玩朝廷，讥嘲国家大事”，更从他的其它诗文中挖一句二句，断章取义的给予定罪，如：“读书万卷不读律，致君尧舜知无术”，本来苏轼是说自己没有把法律一类的书读通，所以无法帮助皇帝成为像尧、舜那样的圣人，他们却指他是讽刺皇帝没能以法律教导、监督官吏；又如“东海若知明主意，应教斥卤变桑田”，说他是指责兴修利的这个措施不对。其实苏轼自己在杭州也兴修利工程，怎会认为那是错的呢？又如“岂是闻韶忘解味，迩来三月无盐”说他是讽刺禁止人民卖盐。总结一句话，是认定他胆敢讥讽皇上和宰相，罪大恶极，应该死刑。

苏轼在御史台内遭到严刑拷问，他自认难逃死罪。最后终能幸免一死。是年十二月二十八日，蒙神宗的恩赐被判放黄州（湖北省黄冈市），苏轼被拘禁近百日，后获释离开御史台之狱。后人把这桩案件的告诉状和供述书编纂为一《乌台诗案》。“乌台”即御史台。《汉书·朱博传》：“是时，兀御史府吏舍百余区井皆竭；又其府中列柏树，常有野乌数千栖宿其上，晨去暮来，号曰朝夕乌。”后世便以御史府为乌府，御史台为乌台。由于这案的发起者都是御史台的言官，他们包括御史中丞李定，监察御史里行（御史台的见习史官）舒亶、何正臣等，因此称为“乌台诗案”。