1848年（光二十八年）38岁3月，纪鸿生。10月，辑录古今名臣大儒言论，修、齐家、治国三门分三十二目辑成《曾氏家训》。

1849年（光二十九年）39岁2月，升授礼右侍郎。9月，署兵右侍郎。

1850年（光三十年）40岁4月，上《应诏陈言疏》，直揭官场“委靡因循”、官吏“畏葸”“柔靡”。“今日所当讲者，惟在用人一端耳”。7月，兼吏左侍郎。

1851年（咸丰元年）41岁1月，洪秀全在广西桂平金田村组织起义。5月，上《敬陈圣德三端预防弊疏》，咸丰帝“怒掷其折于地”罪之。

1852年（咸丰二年）42岁1月，上《备陈民间疾苦疏》。7月，任江西乡试正考官。行抵安徽太湖县小池驿，得母讣闻，回籍奔丧。10月初抵家。太平军广西、湖南，9月攻长沙，10月取决岳州。

1853年（咸丰三年）43岁1月21日，接帮办湖南团练旨。经郭嵩焘力劝保桑梓。30日，抵长沙与湖南巡抚张亮基商办团练。3月19日，太平军攻占江宁，定都为天京。9月，奏准移驻衡州练兵。11月，建衡州船厂赶造战船。派人赴广东购买洋炮，筹建师。

1854年（咸丰四年）44岁2月25日，奉命率师征太平军。发布《讨粤匪檄》。命褚汝航为师总统、塔齐布为陆军先锋，统率17000人，挥师北上。5月，兵败靖港，投自裁获救。7月25日，重整陆各军后，师攻陷岳州。10月14日取武昌。咸丰帝令其署理湖北巡抚。7天后收回成命。改赏兵侍郎衔。12月2日攻陷田家镇。

1855年（咸丰五年）45岁2月12日夜，石达开总攻湘军营，烧毁湘军战船100余艘。曾国藩座船被俘，“文卷册牍俱失”。“公愤极，策赴敌以死”，罗泽南、刘蓉力劝乃止。

1856年（咸丰六年）46岁7月，坐困南昌。9月2日，杨、洪内讧（天京事变）后，太平军元气大伤。10月，曾国藩在长募勇组建吉字营援江西。

1857年（咸丰七年）47岁2月27日，其父去世，偕弟国华回籍奔丧。7月，两次上疏，请求在家终制，获咸丰帝准许。是年建“思云馆”。

1858年（咸丰八年）48岁5月19日，李续宾、杨岳斌率陆两军攻陷九江。弟国华李幕。7月13日，接上谕命其办浙江军务，17日起程。8月5日，抵武昌。与胡林翼会商兵、筹饷之策。11月15日，李续宾、曾国华死于三河之役。12月，作《民歌》以训湘军。

1859年（咸丰九年）49岁1月，李鸿章来建昌谒、留营襄办军务。是月，曾国葆改名贞，湘军，为其兄国华报仇。2月，作《圣哲画像记》。11月，拟四路兵之策，攻取安庆。