在这个思想基本形成以后的二十年左右的时间里，达尔文没有写相关的论文来。有人说达尔文担心受到宗教迫害，而事实是，宗教裁判所早在1600年就已经不用火刑烤人了。不好也只是一方面原因，更漂亮的说法是，达尔文在寻求更全面的理论和事实支持。虽然他了很多看似与这一重要理论毫不相的工作，比如他栽了大量兰，不厌其烦地记录兰开的模式，饲养并观察了很多长相各异的鸽。此间他还费了八年时间写了一籐壶分类和生活史的大著作，连他自己都对此到吃惊。

达尔文了十几年时间整理航海带回的资料，此外他最重要的任务就是思考起源和化的问题。基于前人的研究和他自己的观察与理解，化对他来说是简单的事实，已不再需要怀疑。他的任务是要回答生为什么化和如何化。据他的笔记记载，自1837年7月起，他开始记下关于这一问题的零散的思考过程。在这一过程中，他不但自己植和饲养动植行直接观察和研究，而且不断地与各地的科学家用通信的方式行广泛的和沟通。这是一个漫长和不断重复的思考过程，最后达尔文终于形成了自己的一理论。虽然没有发表，但已基本成形，并在同行科学家之间行了小范围意见。

1842年，达尔文在敦郊外肯特郡达温材购买了一座景幽致柳暗明的乡间别墅。在大海上绕行了遥远的路程后，这个人开始过上了稳定的隐居生活。

最后，有资格这生死裁决的只有大自然，是大自然无不在的大力量，无时无刻不对所有的个行着严格的筛选，这就是“自然选择”！

但时间拖得太长了，达尔文甚至自己都担心完成不了理论完善的工作。为此，他不得不在写了一个基本纲要后向妻作了一个代，万一自己早逝，希望妻能把手稿给赖尔或者胡克这些人，由他们代为整理发表。

据达尔文自己的说法，他在1838年秋天为了消遣，把尔萨斯(thomasmalthus)的《人论》读了一遍，书中所描写的人类生繁荣和生存困难给他留下了刻的印象。尔萨斯断定，要解决人增长与资源短缺问题，饥饿、战争和瘟疫是必不可少的手段，只有这样才能大幅度裁减多余人，特别是裁减穷人。据说正是《人论》让达尔文突然在脑海中闪现了自然选择的念，这似乎是一个非常有戏剧的过程。

古尔德之所以特别看重这个问题，是想告诉所有人，像化论这对人类来说非常重要而又极创新的思想系，不可能是灵光一闪那样可以简单地一蹴而就的小事情，这是人类对自然长期探索和思辨的结果。达尔书完成了其中的重要一环，就算这个灵光一闪的传说是真实的，那也是建立在长期思考的基础之上的，而绝不是像撞球那样偶然完成的，那是顺着思想的长河向前探源的必然结果。

其实达尔文本人关于化的观与后来被化论学者们一再修订过的理论有很大的，这个理论有了一个新的名字，叫“现代达尔文主义”，但“生化”和“自然选择”这两个内基本没有被动摇过。不妨先看看达尔文自己关于化论思想的要：

复次，一母生九，九各不同，不同的变对环境有不同的适应能力。适应下来的才会成功地生存下去，并把优势遗传给下一代，否则就是可怜的被淘汰者。此所谓“适者生存”也。

但后来的化论学者古尔德拒绝接受这说法，他认为达尔文灵光闪现式的传说虽然迷人，也容易为大众所津津乐，但这说法却是不可信的。据达尔文的笔记，他当天只是非常平淡地记录说已读过《人论》，没有提及任何想，甚至连一个叹号都没有加上，这对于经常连用三个叹号以表示开心或惊奇的达尔文来说，只能说明尔萨斯对他的启发作用是有限的。

达尔文仍在拖拉中，正当一切看起来毫无希望的时候，如文章开始介绍的那样，华莱士突然登场了，达尔文大吃一惊，《起源》是这样被了来。

其次，变异的方式是一地、渐渐地、悄悄地变，在达尔文自己的控制范围内，是反对跃式的变异的。

首先，达尔文明确并充分证明了生是变异的。

再次，达尔文相信都有大的繁能力，其繁数量之庞大，大大超过了自然的承受能力。所以后代必经大量淘汰，这是竞争存在的源。

只有他的大脑，却一刻没有停止过思考。

这几条，无一不成为后来斗争的焦，即便在化论者内，除第一条和最后一条外，也不断地产生不同的声音。正是这些争论，使化论得以不断向前发展。

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但应该承认，他的这些工作都是有目的的，是围绕着一个中心展开的，那就是意图去证明他的关于化和适应的思想。达尔文相信，在有限的时间内经过人工培育而发生的变异完全可以与自然界发生的变异相比拟，只不过是以自然选择代替了人工选择而已。