，除觉斯名，移狱镇抚司掠治，乃还刑狱。逾年，尚书刘泽等言：“二人罪至永戍止矣，过此惟论死。论死非封疆则贪酷，未有以建言者。周无封疆贪酷之罪，而有建言蒙戮之名，于周得矣，非我圣主覆载之量也。陛下所疑者党耳，党者，见诸行事。周抗疏，只托空言，一二知相从罢斥，乌睹所谓党，而烦朝廷大法乎？且陛下岂有积恨周，万一圣意转圜，而臣已论定，悔之何及。”仍以原拟请，乃永戍广西。

十五年八月，周戍已经年。一日，帝召五辅臣文华后殿，手一编从容问曰：“张溥、张采何如人也？”皆对曰：“读书好学人也。”帝曰：“张溥已死，张采小臣，科官何亟称之？”对曰：“其中自有书，科官以其用未竟而惜之。”帝曰：“亦不免偏。”时延儒自以嗣昌既已前死矣，而己方再相，参用公议，为周地也，即对曰：“张溥、黄周皆未免偏，徒以其善学，故人人惜之。”帝默然。德璟曰：“周前日蒙戍，上恩宽大，独其家贫幼，其实可悯。”帝微笑，演曰：“其事亲亦极孝。”行甡曰：“周学无不通，且极清苦。”帝不答，但微笑而已。明日传旨复故官。周在途疏谢，称学龙、廷秀贤。既还，帝召见周，周见帝而泣：“臣不自意今复得见陛下，臣故有犬之疾。”请假，许之。

居久之，福王监国，用周吏左侍郎。周不，士英讽之曰：“人望在公，公不起，从史可法拥立潞王耶？”乃不得已趋朝。陈取九策，拜礼尚书，协理詹事府事。而朝政日非，大臣相继去国，识者知其将亡矣。明年三月，遣祭告禹陵。濒行，陈取策，时不能用。甫竣事，南都亡，见唐王聿键于衢州，奉表劝。王以周为武英殿大学士。周学行，王敬礼之特甚，赐宴。郑芝龙爵通侯，位周上，众议抑芝龙，文武由是不和。一诸生上书诋周迂，不可居相位，王知芝龙意，下督学御史挞之。

当是时，国势衰，政归郑氏，大帅恃恩观望，不肯一关募兵。周请自往江西图恢复。以七月启行，所至远近响应，得义旅九千余人，由广信衢州。十二月至婺源，遇大清兵。战败，被执至江宁，幽别室中，囚服著书。临刑，过东华门，坐不起，曰：“此与皇帝陵寝近，可死矣。”监刑者从之。幕下士中书赖雍、蔡绍谨，兵主事赵士超等皆死。

周学贯古今，所至学者云集。铜山在孤岛中，有石室，周自幼坐卧其中，故学者称为石斋先生。天文历数皇极诸书，所著《易象正》、《三易玑》及《太函经》，学者穷年不能通其说，而周用以推验治。殁后，家人得其小册，自谓终于丙戌，年六十二，始信其能知来也。

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后人纪念

黄周胜迹、故居联

纲常万古谁能偶；

节义千秋孰比肩。

横批：为善最乐

——黄典诚题福建省东山县铜陵黄周故居中堂

仰止山已表儒林首；

朔游学海群推岸先生。

——佚名题福建省漳浦县东山岛云山石室黄周少年读书

浩然正气，直与文山同壮烈；

卓尔奇才，长教左海焕光芒。

——黄寿棋题福建省漳浦县东郊石斋村黄周纪念馆

收局文山，气节冰霜千古烈；